新皇岗口岸建成后，通关模式将以“合作查验、一次放行”，取代原有的“两地两检”，市民在皇岗口岸只需一次上下车、一次排队，即可完成深港两地查验手续，通关时间将从原来半小时左右，缩短为5分钟左右。